中央研究院

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1.植物暨微生物學研究：   (1)立基於本所現有的發展基礎，本所在105年度將持續   　 強化植物學與植物有關之微生物學的基礎研究，平   　 衡植物及微生物功能性基因與體學研究，並致力於   　 配合本院與國家政策，整合並發展具有國際競爭力   　 之跨領域與群體合作計畫，研發以植物及微生物為   　 主體之農業生物技術及生質能科技，進一步提升本   　 所在國際學界的能見度，同時對國家農業生技產業   　 發展有所貢獻。   (2)105年度研究將著重於植物功能性機制及植物與微生   　 物交互作用機制兩大主軸，我們將特別重視基礎及   　 應用科學之間的平衡，並將重心聚焦於“發現、利   　 用和保留特殊的植物有用基因與資源”。 2.細胞與個體生物學研究：研究領域   (1)水生生物與海洋生物科技。   (2)細胞結構與個體功能分析。   (3)個體功能障礙及疾病分子基礎。   (4)神經科學。   (5)幹細胞機制及應用。 3.生物化學研究：   (1)蛋白質轉譯後修飾及訊息網路研究：以發現藥物靶   　 標主旨在研究各種蛋白質轉譯後修飾作用調控訊息   　 傳遞途徑之分子機制與生理病理功能，以尋找重大   　 疾病之生物標示。本所負責主持之國家級蛋白質體   　 與質譜核心設施設置於本所。藉由新穎的質譜分析   　 與定量之技術平台，針對生物標本中各種蛋白質轉   　 譯後修飾作系統性分析，此外亦可對特定蛋白質之   　 轉譯後修飾作專一性分析。   (2)以蛋白質結構為基礎之藥物設計與研發：結構生物   　 學長期以來為本所研究重點及強項。在前任和現任   　 所長的領導下建立了深厚基礎。現有研究人員，加   　 上研究技師提供技術支援，生化所已組成實力堅強   　 之研究團隊，在研究設施上，國家級之x-ray結構分   　 析核心，及院級之生物物理核心均設置於本所，加   　 上本所現有之NMR核心設施，使本所成為設備先進完   　 善之結構生物研究重鎮。除上述結構生物學家外，   　 本所亦有多位研究人員專長化學生物學，致力於小   　 分子或天然物藥物研發及開發專一性與效能兼具之   　 藥物傳輸系統，達成轉譯醫學之目標。   (3)目前本所擁有數位醣科學研究方面人員，其研究方   　 向涵蓋醣基化及轉化酵素之生物功能及小分子抑制   　 藥物之研發，醣類辨識，醣類分析，醣類合成，及   　 醣質體與免疫關聯性等。 4.生物醫學科學研究：   (1)生醫所65位(專任+研究技師)研究人員分為七個研究   　 組群，從事疾病相關的研究工作：     <1>流行病學與遺傳學研究組。     <2>細胞/發育生物學與再生醫學研究組。     <3>感染疾病與免疫學研究組。     <4>神經科學研究組。     <5>心臟血管研究組。     <6>癌症研究組。     <7>結構生物學研究組。   (2)經過十餘年的基因體醫藥研究，生醫所的研究人員   　 以團隊組合方式已經適應了基因體及疾病遺傳性研   　 究的快速變化，而且也利用新的研究知識問津人類   　 疾病形成的機制與原因，所謂的轉譯醫學研究，亦   　 在此領域內，本所已在國際生醫研究上佔有一席之   　 地。   (3)在中程學術發展上，我們將繼續我們的共同目標－   　 基因醫藥研究，利用不同的方法，在極其複雜的，   　 多因性的人類疾病中，找出更新的疾病相關基因，   　 或者是致病基因，改善人類以基因為主的疾病預防   　 、診斷及治療的效果。結合醣質、炎症與疾病關係   　 為主的研究，已建立醣質醫學研究平台，結合本院   　 及其他醣質研究人員，以醫學觀點出發，研究醣質   　 在炎症及其他疾病成因及產生上的重要性。近來研   　 究發現，自體幹細胞治療可促進血管新生。鑑於此   　 ，本所研究發現，在肌肉內注射生物相容性水膠混   　 合自體骨髓細胞可促進血管再生。在下肢缺血的小   　 動物如小鼠、大鼠或中型動物如豬等，皆得到顯著   　 效果。目前利用自體幹細胞促進血管再生的臨床治   　 療研究，由本院聯合臺大、成大醫學院正在申請進   　 行。   (4)所以在中程發展上，基因治療與細胞治療，以及炎   　 症與疾病關係的瞭解，將是我們努力的目標。   (5)在長期學術發展上，本所將朝向人體醫療個人化目   　 標前進。臺灣人體生物資料庫(Taiwan Biobank)的   　 建立將蒐20萬社區居民以及10萬名，10至15種慢性   　 病人的檢体，包括生活習慣，環境因子，生物標誌   　 ，遺傳基因結構等資料，加以分析，建立國人的健   　 康變化情形。   (6)104年底，衛福部核准本院、陽明醫學院、臺大醫學   　 院、國家衛生研究院及工業技術研究院食工所合作   　 的人體誘發性多功能幹細胞(iPS)庫的建立，擬於兩   　 年內建立100株國人的iPS株，做為以後治療或藥物   　 測試之用，研究平台建於生醫所。   (7)人體生物資料庫與人體誘發性多功能細胞庫的資訊   　 相結合，將為國人開啟個人醫療化的第一步。 5.分子生物研究：   (1)研究領域：     <1>染色體生物學。     <2>發育生物學。     <3>感染與免疫生物學。     <4>神經生物學。     <5>植物分子生物學。     <6>核醣核酸生物學。     <7>結構生物學。     <8>系統生物學。   (2)人才培育：本所目前有永久性研究人員（59人）、   　 博士後研究員(17人)、博士生(20人)、碩士生(17人   　 )、助理(37 人)，實行以來甚得各方支持。仍繼續   　 尋求更進 一步之發展。本所並與臺北醫學大學、陽   　 明大學、臺灣大學，國防醫學院等院所聯合訓練博   　 士班及碩士班學生，積極參與研究人才培育。 6.農業生物科技研究：   (1)植物環境逆境研究：探討氣候變遷對臺灣水稻生產   　 之影響及發展新一代能適應環境變遷的作物品系。   　 我們也將推動一個新興計畫，探討植物對不同生物   　 性和非生物性環境逆境下之交互反應。我們將以水   　 稻、蘭花為主要標的作物，以阿拉伯芥為輔助模型   　 植物，來研究植物受逆境誘導的基因調控與抗逆反   　 應；以基因體、蛋白質體、代謝體和生物資訊學等   　 研究系統，使用高通量核酸序列分析和質譜儀等先   　 進實驗工具，來找尋與環境逆境相關的基因群，並   　 闡釋其功能、評估其應用價值。   (2)草藥科技研究：以GAP的方式栽培研究用的藥草，訂   　 定藥草栽培、採收的農藝規範。用基因轉殖、代謝   　 工程、植物逆境等方式，研發創新、高效率的植物   　 二級代謝物代謝體分析與天然藥物研究方法。   (3)分子疫苗及酵素科技研究：研究重點包括新興流感   　 之類病毒顆粒疫苗技術的研究與改進、 探討禽類免   　 疫細胞辨識病毒的機制及應用、探討調控骨髓衍生   　 抑制細胞的免疫機制與作為免疫療法的應用策略、   　 利用蛋白質工程策略提升木質素分解酵素的活性與   　 功能以增進其在工業之應用性及活性天然物合成酵   　 素基因之選殖、鑑定與代謝工程。 7.生命科學圖書館：   (1)生命科學相關中西文圖書及視聽資料採購，編目及   　 典藏。   (2)徵集與訂購各式生命科學相關專業期刊。   (3)推廣各式圖書、電子書、期刊及電子資料庫資訊之   　 利用。   (4)統計各項圖書館相關資料暨評估工作效益。 8.臨海研究站：   (1)建立魚類視蛋白基因表現與修飾細胞培養系統。   (2)吳郭魚抗菌胜月太(TP4)與石斑魚抗菌胜月太(epine   　 cidin-1)在治療幽門桿菌感染老鼠後之存活率與可   　 能之藥物開發。   (3)吳郭魚抗菌胜月太(TP3與TP4)，以電破法電破表達   　 質體在肌肉上，測試是否可以增加存活率與抑菌率   　 。   (4)無顎類跟有顎類軟骨發育相關基因的比較研究。   (5)金魚臀鰭尾鰭與的發育遺傳學。   (6)分析石斑魚TLR9(gTLR9)訊息傳遞機制對於RNA選擇   　 性裁剪相關之RNA polymerase II的調控機制。   (7)浸泡型佐劑在石斑魚抗病毒疫苗最佳化。 9.生物多樣性研究計畫：   (1)「基因」多樣性之研究：     <1>造礁珊瑚基因體多樣性與種化。     <2>海洋共生微生體基因體多樣性研究。     <3>臺灣本土經濟性及瀕危動植物遺傳多樣性與演化     　 研究。     <4>臺灣經濟性及本土魚類基因條碼資料庫之建置。     <5>果蠅族群遺傳及分子演化。     <6>社會性昆蟲之演化遺傳研究。     <7>海洋浮游動物多樣性之研究。   (2)「物種」多樣性之研究：     <1>臺灣本土動植物、微生物之系統分類學之研究。     <2>臺灣生物多樣性、生態與工程資料庫、資訊網之     　 整合及與國際接軌。     <3>推動臺灣生物多樣性量化指標-物種數指標之建立     　 。   (3)「生態系」多樣性之研究：     <1>全球氣候變遷與人為擾動下之珊瑚礁生態系與濕     　 地生態系的抵抗力與恢復力之研究。     <2>南中國海、臺灣各離島、墾丁及西海岸、河口溼     　 地、高山湖泊生態系功能與彈性之研究。     <3>臺灣植物及海洋生物多樣性分布類型及其形成機     　 制之比較研究及人為及自然因素之影響。   (4)棲地復育及經營管理研究：     <1>劣化濕地之復育及其經營管理。     <2>生物多樣性之保育及復育與社區營造及外來入侵     　 種之防治。     <3>海域人工棲地生態系食物階層及能量流動之研究     　 。 10.基因體研究計畫：近期的研究方向著重於對國人重大 　 疾病的瞭解，進行人類疾病與微生物基因體、蛋白質 　 體、及醣體學結構與功能等研究，以及開發新的技術 　 及藥物。透過前瞻性、創新性、與可行性的跨領域研 　 究，發展高靈敏度的研究平台和儀器，以增進對疾病 　 的瞭解，進而發展新型的藥劑、疫苗、抗生素，因此 　 目前的研究重點為：重大疾病的防治－針對新流感 (H 　 1N1) 及禽流感 (H5N1) 等病毒、泛抗藥性結核菌及金 　 黃色葡萄球菌 (MRSA) 等細菌、乳癌及肺癌等，分析 　 其關鍵生物分子之功能及與疾病的關係；新技術開發 　 －發展超高速新藥篩選系統、醣晶片、全功能生物質 　 譜儀、奈米材料的技術及功能，以及演化基因體研究 　 平台；此外，也進行天然物藥劑及癌症幹細胞的研究 　 ，以研發檢測與防治疾病的新策略。   (1)化學生物學專題中心：著重於利用化學與生物學的   　 方法來瞭解及解決生命系統的問題，尋找新的化學   　 方法進行功能基因體學研究及藥物開發。   (2)醫學生物學專題中心：著重於發展和測試小分子藥   　 物、抗體藥物和疫苗、以及免疫藥物來預防、診斷   　 和治療疾病，發展轉譯醫學研究。   (3)物理與資訊基因體學專題中心：著重於資訊處理及   　 發展高創意的生物技術，進行物理基因體學及計算   　 基因體學相關研究，發展高創意的生物科技。 11.南部生物技術計畫中心計畫：   (1)本院南部生物技術中心(以下稱為南科中心)整體研   　 究重點將著重在水稻及蘭花生物技術的基礎研究以   　 及生物有用基因之開發。主要研究計畫如下：     <1>溫度對蝴蝶蘭開花之調控機制。     <2>水稻逆境反應基因作用機制之研究。     <3>)決定水稻植株高度與分蘗數相關基因研究。     <4>篩選增進誘發蝴蝶蘭擬原球體發育的轉譯分子。   (2)在設施服務方面，將繼續提供基因轉殖溫室給本院   　 研究人員使用，作為進行繁殖及小型溫室性狀與產   　 量試驗之用；建立基改作物田間試驗作業平臺，以   　 提供院內研究人員基改作物田間試驗之服務。並建   　 立原位雜交及共軛焦顯微鏡核心實驗室，以做為基   　 因表達標示及細胞影像分析系統，提供南科中心及   　 南港院本部研究人員細胞生物之技術服務。   (3)延攬人才方面，本中心將延聘一名從事轉譯農學及   　 植物生長調控之助研究員，以增強本院南科中心植   　 物生長發育研究團隊之研發能量。同時，培訓博士   　 後及碩博士研究生及助理於南科中心進行水稻、蝴   　 蝶蘭及扇型文心蘭基因功能性研究，並與南港院本   　 部農業科技研究中心的基因體及生物資訊的研究團   　 隊密切合作，建構水稻及蘭花之基因體資源。   (8)探索體細胞重新編程以及幹細胞更新與分化。   (9)分析轉錄因子在免疫細胞分化過程中的調控機制。   (10)研發針對標的物的療法，開發新穎治療性及預防性    　 疫苗。   (11)探討癌細胞與微環境之間的相互作用與分子機制。   (12)探索免疫細胞發育與成長的轉錄調控，及其與感染    　 病原及腫瘤的交互作用。   (13)建立疾病模式及進行臨床前相關研究。   (14)對流行病的可能擴散和損害作有效性的評估。   (15)開發新的生物質譜技術。   (16)研發生物奈米材料。   (17)發展新的循環癌細胞的檢測系，找尋疾病標的分    　 子，及進行細胞、病毒、奈米藥物等的偵側與分析    　 。   (18)發展可應用於研究細胞功能等生物醫學相關研究的    　 電腦模擬平台。 11.南部生物技術計畫中心計畫：   (1)建構蝴蝶蘭及扇型文心蘭生長於不同溫度之基因表   　 達圖譜，並用以探討蝴蝶蘭低溫開花需求的分子機   　 制並鑑定促進。開花所需之功能性基因。   (2)水稻逆境反應基因作用機制之研究：我們將利用水   　 稻表現不同逆境誘導之基因，建立轉殖植物，並探   　 討其抗不同逆境之能力，並篩選抗旱、耐鹽分的水   　 稻品系，並利用這些轉殖株探討水稻於逆境下訊息   　 傳導之機制。這些研發結果將有助於我國對植物抗   　 逆境的生技應用研發，並增進番茄及其他重要作物   　 的抗逆境性狀之生物技術。這些植物將進行生物晶   　 片分析，同時也利用LC-MS-MS進行蛋白質差異比對   　 ，再以代謝體分析圖譜來瞭解一次及二次代謝物在   　 逆境下的差異圖譜，以瞭解抗逆境調控機制。我們   　 期望可以生產出能夠抵抗環境之水稻新品系，並協   　 助台灣農業尖端生技產業之發展。   (3)決定植株高度與分蘗數相關的水稻基因: 鑑定植物   　 構型相關的新基因，並針對其作後續的功能性分析   　 。先前，我們已發現數個與決定植株高度與分蘗數   　 相關的水稻基因。我們將訂定這些基因的訊號傳遞   　 路徑，及與之互動的蛋白質，以瞭解整個分子網路   　 架構。   (4)篩選增進誘發蝴蝶蘭擬原球體發育的轉譯分子：使   　 用RNA定序技術來分析和比較發育中的胚、原球體和   　 擬原球體的基因群。找出原球體/擬原球體和發育中   　 的胚組織不同調控的轉錄因子。並於篩選後分離和   　 鑑定具有維持和/或誘導擬原球體分生組織的能力的   　 轉錄因子。並經由瞭解轉錄調控因子的功能研究誘   　 發蝴蝶蘭擬原球體的發生加速組織培養效率，增進   　 蘭花生技的研發能量。

1.植物暨微生物學研究：本所將致力開創新的研究方向與 　領域，追求學術創新與卓越，可以預期本所在105年度 　將持續在國際知名期刊中發表重要研究論文，並在質與 　量上都與時俱進，在國際上的能見度與學術影響力也將 　持續增加。   (1)在植物功能性機制研究方面：這部分的研究將增進   　 植物學嶄新知識，發掘控制植物生長、發育相關功   　 能性基因，進行功能性分析。另一方面，將進一步   　 瞭解植物基因如何調控因應環境變遷。這些研究結   　 果將是農業應用上的基石，提供作物栽培或是分子   　 育種的根據，讓植物的生長發育可受人為控制，創   　 造農業價值，讓作物更具環境適應力、更有效利用   　 或適應環境外在訊息，讓作物得以有最佳化的生長   　 ，有效因應可預期的環境變遷。   (2)在植物與微生物交互作用機制研究方面：病毒、細   　 菌與真菌是造成植物許多病害的元兇，對相關病原   　 菌的基礎分子構造與作用機制的深入瞭解，可以在   　 學理上做出貢獻外，將所獲得的知識應用於開發植   　 物抵抗病原菌的策略，減低作物因病害產生的重大   　 農損，增加農業收益。 2.細胞與個體生物學研究：   (1)水生生物與海洋生物科技：     <1>魚類適應低温的分子生理機制。     <2>廣溫鯉魚肌酸激酶在低溫下分子反應機制之研究     　 。     <3>斑馬魚黏蛋白mucin基因的分析及功能性的研究。     <4>虹彩病毒和神經壞死病毒在宿主與非素主選擇性     　 感染機制之研究。     <5>動物胚胎建立左右不對稱發育之分子機轉。   (2)細胞結構與個體功能分析：     <1>探討斑馬魚肝內膽道癌之源頭細胞及其機轉。     <2>昆蟲費洛蒙之研究。     <3>飲食和老化影響果蠅卵巢生殖幹細胞功能的分子     　 機制。     <4>轉錄因子 Lhx2 在大腦發育中的功能。     <5>第十型葡萄糖運送子 GLUT10 的生理功能。     <6>研究超嗜熱古生病毒感染宿主和基因包裝及重組     　 的機制。   (3)個體功能障礙及疾病分子基礎：     <1>基因體穩定性及細胞老化。     <2>標的藥物傳輸系統運用於癌症的影像醫學及治療     　 。     <3>表皮生長因子受體拮抗劑於阿茲海默症新藥開發     　 之轉譯醫學研究。     <4>探討熱休克轉錄因子在細胞轉型過程中所扮演的     　 角色。     <5>反式剪接核糖核酸於控制全能分化性及細胞分化     　 的功能及機制。     <6>組蛋白H2B的動態泛素化在哺乳動物中的功能。   (4)神經科學：     <1>系統性研究區域中介神經元的發育及其嵌入神經     　 迴路之機制。     <2>探討大腦區塊化之分子機制。     <3>>四維活體影像來研究休眠神經幹細胞活化。     <4>海洋酸化對點帶石斑魚嗅覺生理與攝食行為影響     　 的研究。     <5>比較分析頭索動物文昌魚與脊椎動物神經系統發     　 育機制。     <6>人類全功能性幹細胞於大腦皮質分化形成之分子     　 基礎研究。   (5)幹細胞機制及應用：     <1>發展新穎之誘導性神經幹細胞產製方法以利用於     　 神經退化性疾病之研究。     <2>研究胚胎與腫瘤幹細胞表面抗原及探討其功能與     　 運用。     <3>糖尿病對果蠅生殖幹細胞的影響及其分子機制。     <4>糖尿病對果蠅生殖幹細胞的影響及其分子機制。     <5>探討調控大腦神經細胞數量之分子機制。 3.生物化學研究：   (1)除了各種體外與活體研究外，本所亦已建立與醫院   　 之合作管道，如臺大、北醫大、三總、慈濟…等，   　 希望能將研究成果在病患檢體上得到驗證，以達到   　 轉譯科學之目標。藉著〝由化學到生物學〞研究模   　 式與平台，在未來二年內，本所預計將在訊息網路   　 解析及藥物標靶發現上有重要突破。   (2)未來二年本所在蛋白質結構與藥物設計研發之主要   　 對象包括：致病微生物標的蛋白， 重要疾病之藥物   　 標的蛋白。此外，我們也將著重於蛋白複合體及膜   　 蛋白之結構解析，以利新穎藥物設計。這些研究成   　 果不但將具高度學術重要性，且預計將能移轉至產   　 業界，促進我國生技產業發展。   (3)未來二年本所之醣科學研究將聚焦於醣質體質譜分   　 析新技術研發，特別是針對較困難定位之 site spe   　 cific modifications 及含量稀少的醣蛋白鑑定，   　 以及醣類相關生物資訊平台建立，以期發現重大疾   　 病，如癌症、感染症之醣類相關生物標示。另外也   　 著重於細胞表面醣抗原在癌症轉移上之功能與機制   　 ，並以細胞膜醣蛋白做為癌症生物標記等。 4.生物醫學科學研究：   (1)本所在未來預算年度整體重點研究將朝向三個目標   　 ：     <1>轉譯醫學研究。     <2>炎症與疾病關係的研究。     <3>醫療個人化研究。   (2)以此三方向實現生醫所的創所目標，基礎與臨床醫   　 學並進，加強對疾病診斷，預防與治療的效果，增   　 進國民健康的福祉。這個轉變是本所自2002年全面   　 調整為醫藥基因體研究以來最大的改變，使本所由   　 基礎研究，漸漸轉化入臨床治療研究，跨出了一大   　 步。 5.分子生物研究：   (1)染色體生物學:     <1>RNA干擾造成染色體的重組。     <2>經濟性真菌有性生殖分子機制研究與應用。     <3>Cdc48對蛋白酶體功能的調控。   (2)發育生物學：     <1>哺乳類紅血球蛋白基因群表現的調控機制。     <2>果蠅同源異形基因調控之分子機制。     <3>類固醇荷爾蒙的功能與調控。   (3)感染與免疫生物學：     <1>研究脂質筏蛋白體中之蛋白質對抑制牛痘病毒感     　 染寄主之重要性。     <2>登革熱病毒複製機制的研究。     <3>探討桿狀病毒IE2 新奇轉錄體之強轉錄機制及其     　 應用。     <4>研究腸免疫反應及自然殺手細胞功能。     <5>Innate CD4 T淋巴細胞之發育與功能。     <6>泛素E3連結酶Deltex主導蛋白分解以維持免疫耐     　 受性及引發細胞死亡。   (4)神經生物學：     <1>研究胚胎中樞神經系統（CNS）的發育及退化過程     　 。     <2>先天性免疫反應調控神經發育及神經退化。     <3>果蠅成蟲視覺系統退化：膠原細胞與神經細胞交     　 互作用。     <4>泛素化作用在突觸之形成與塑性。     <5>生長休止基因七在帕金森氏症致病機轉中的角色     　 。     <6>蛋白酶體系統在神經細胞極化與發育之角色探討     　 。   (5)植物分子生物學：     <1>利用遺傳及遺傳工程的方法改善水稻的氮利用效     　 率。     <2>蛋白質選擇性輸入不同種色質體的機制。     <3>缺糖訊息傳遞與基因調控對水稻生長的影響。     <4>阿拉伯芥α-澱粉水解酵素的功能分析。   (6)核醣核酸生物學：     <1>剪接催化反應調控的機制。     <2>核醣核酸分解的機制。   (7)結構生物學：     <1>複製叉系統中ＤＮＡ解旋機制與修復機制的探討     　 。     <2>形成纖維聚集之蛋白質與疾病的相關性。     <3>酵母菌普里昂蛋白之變異與傳遞。     <4>第三型核醣核酸聚合酶轉錄起始複合體之結構與     　 形成機制。   (8)系統生物學學：     <1>酵母菌種化的分子機制。     <2>開發新ㄧ代高通量測量蛋白質降解速率的技術。     <3>速瘦引發細胞代謝活性之機轉。 6.農業生物科技研究：   (1)植物環境逆境研究：建立水稻及阿拉伯芥對環境逆   　 境耐受性之分子機制。所研究之環境因子包括高溫   　 、乾旱、淹水、低養份、重金屬，並鑑定調控對不   　 同逆境耐受性之關鍵基因，並將研發結果應用於分   　 子育種，以培育新一代之水稻抗環境逆境之新品系   　 。我們並預期以次世代定序技術及生物訊息分析方   　 法建立臺灣重要農作物基因體資料庫，此資料厙將   　 可提供國內研究基因體資源，對促進台灣農業生技   　 研究有重大助益。   (2)草藥科技：藥草醫療保健功能方面，研究各種臺灣   　 可種植的藥草針對抗發炎、抗腫瘤、抗癌轉移、癌   　 症治療佐劑、免疫調節、免疫佐劑等，並將藥草所   　 含之有效化學成分分離與鑑定。研發創新的串聯式   　 代謝物圖譜分析的技術學，用於鑑定醫療保健功效   　 相關成分、分析特定的或有藥效的化合物在植物中   　 的生合成途徑、與其在動物體內的代謝物圖譜，以   　 及有藥效成分在動物體內之可利用率的研究。   (3)分子疫苗及酵素科技：開發H1N1、H3N2等人流感的V   　 LP疫苗，研究這些新型VLP疫苗針對相同亞型但抗原   　 飄移的流感病毒株，甚至相近亞型間的最大保護範   　 圍與其作用原理，完成以VLP方式生產針對流感病毒   　 HA2區的前瞻疫苗技術，擴大季流感疫苗保護力的涵   　 蓋範圍。探討活性成分之生合成途徑，利用轉錄體   　 學配合代謝體學研究，欲由紫錐菊與大花咸豐草中   　 選殖參與此兩類活性成分之合成酵素基因，並將進   　 行重組蛋白質的表達、酵素特性鑑定與小分子終產   　 物於植物中表達的化學圖譜分析，以期獲得活性化   　 合物的代謝或生合途徑的重要資訊，最終將選擇幾   　 個關鍵酵素基因，直接進行藥用植物之基因轉殖工   　 作，測試對植物所含目標活性化合物生合成的影響   　 。 7.生命科學圖書館：   (1)第8年年度加入臺灣電子書聯盟共同採購作業，將使   　 得本館電子書大量成長約1萬餘冊，並加強推廣使用   　 。   (2)積極推廣本館館藏及生命科學相關網路資源之利用   　 ，以支援生物組6所暨2中心之學術研究。   (3)持續維護生物組研究成果及機構典藏系統提高論文   　 能見度，並主動提供研究人員最新被引用次數資訊   　 。   (4)評估核心期刊訂購以利配合年度預算執行。   (5)推出新型文獻服務，方便且快速取得生圖未訂購的   　 書刊資源。 8.臨海研究站：   (1)經由本系統可確認魚類的視蛋白基因在演化過程中   　 對色光敏感度變異所造成的影響。   (2)吳郭魚抗菌胜月太(TP4)與石斑魚抗菌胜月太(epine   　 cidin-1)在治療幽門桿菌感染老鼠後，能完全消滅   　 幽門桿菌，提供藥物開發之可行性。   (3)吳郭魚抗菌胜月太(TP3與TP4)，以電破法電破表達   　 質體在肌肉上，具有增加存活率與抑菌效果。   (4)揭示脊椎動物骨骼系統祖先狀態。   (5)利用正向遺傳學鑑定影響金魚與臀尾尾鰭發育之主   　 要基因。   (6)進一步瞭解gTLR9下游訊息途徑如何改變RNA polyme   　 rase II而影響選擇性裁剪結果。   (7)針對已發展出的浸泡型石斑魚虹彩病毒疫苗做最佳   　 化的研發。 9.生物多樣性研究計畫：   (1)「基因」多樣性之研究：     <1>完成美麗軸孔珊瑚之核基因體完全定序，提供研     　 究珊瑚種化機制探討的工具。     <2>完成與珊瑚共生之微生物的基因體研究，提供海     　 洋共生機制之演化探討。     <3>臺灣重要植物、魚類之地理親緣及族群結構。     <4>完成多種本土(含經濟性）類生命條碼資料庫之建     　 置。     <5>探討果蠅性費洛蒙多樣性的相關基因演化。     <6>了解臺灣動植物相之形成及其維繫機制，可應用     　 在生物多樣性之維護及經營管理。     <7>了解社會性組織相關超級基因之特性及基因構造     　 。     <8>了解螞蟻的性別決定機制。     <9>完成以分子為基礎之浮游動物多樣性評估方法，     　 並應用於野外採集樣本。   (2)「物種」多樣性之研究：     <1>發表臺灣新紀錄或新種之動植物、微生物，完成     　 若干科或屬之分類整理，重建符合演化之分類系     　 統。     <2>充實國家網站有關生物多樣性及生態工法之資訊     　 ，並與國際接軌，對研究、教育、立法及保育上     　 均為重要。     <3>充實臺灣物種電子名錄，提供本土種、外來種、     　 瀕危種之鑑識特徵及種數資料，並充實資料庫。   (3)「生態系」多樣性之研究：     <1>揭櫫在全球氣候變遷(海水升溫、海平面上升與酸     　 化)與人為擾動（過漁、棲地破壞與污染）衝擊下     　 ，珊瑚礁、海岸、河口生態系的恢復力與因應策     　 略。     <2>闡明各離島及南海深淺水層海洋生物多樣性與海     　 岸、河口濕地、高山湖泊之維繫機制，建立長期     　 研究計畫之推動模式，建議劃設及管理保護區之     　 方法。     <3>分析比較臺灣植物及深淺水層海洋生物分布類型     　 ，推衍其遷移模式和形成機制，及環境因素變化     　 對其影響的程度，並推估其面對環境衝擊時所可     　 能發生的變化。   (4)棲地復育及經營管理研究：     <1>建立海岸、河口濕地溫室氣體排放時空分布資料     　 ，並研議劣化濕地經營管理策略與方案。     <2>實際協助推動生物多樣性復育、外來入侵種之防     　 治、海洋保護區之劃設、及攸關永續利用之社區     　 營造。     <3>藉由研究比較不同海域人工棲地生態系演替上的     　 差異，將結果應用於特定海洋生物資源的復育。 10.基因體研究計畫：   (1)開發新型抗病毒、抗癌和抗菌疫苗。   (2)建立醣晶片新技術，開發流感病毒快速篩檢的新技   　 術。   (3)基因改良最後一線抗生素的藥效活性，對付多重抗   　 藥性細菌。   (4)瞭解神經退化疾病之類澱粉蛋白摺疊及堆積的機制   　 ，發展新型偵測及治療方法。   (5)結合龐大分子庫與篩選系統，加速新型藥物的研發   　 。   (6)找尋與分析癌症細胞與癌症幹細胞的生物標記。   (7)研究基因調控因子和基因外修飾對成人及胚胎幹細   　 胞的作用，探討細胞分化的調控機制。   (8)探索體細胞重新編程以及幹細胞更新與分化。   (9)分析轉錄因子在免疫細胞分化過程中的調控機制。   (10)研發針對標的物的療法，開發新穎治療性及預防性    　 疫苗。   (11)探討癌細胞與微環境之間的相互作用與分子機制。   (12)探索免疫細胞發育與成長的轉錄調控，及其與感染    　 病原及腫瘤的交互作用。   (13)建立疾病模式及進行臨床前相關研究。   (14)對流行病的可能擴散和損害作有效性的評估。   (15)開發新的生物質譜技術。   (16)研發生物奈米材料。   (17)發展新的循環癌細胞的檢測系，找尋疾病標的分    　 子，及進行細胞、病毒、奈米藥物等的偵側與分析    　 。   (18)發展可應用於研究細胞功能等生物醫學相關研究的    　 電腦模擬平台。 11.南部生物技術計畫中心計畫：   (1)建構蝴蝶蘭及扇型文心蘭生長於不同溫度之基因表   　 達圖譜，並用以探討蝴蝶蘭低溫開花需求的分子機   　 制並鑑定促進。開花所需之功能性基因。   (2)水稻逆境反應基因作用機制之研究：我們將利用水   　 稻表現不同逆境誘導之基因，建立轉殖植物，並探   　 討其抗不同逆境之能力，並篩選抗旱、耐鹽分的水   　 稻品系，並利用這些轉殖株探討水稻於逆境下訊息   　 傳導之機制。這些研發結果將有助於我國對植物抗   　 逆境的生技應用研發，並增進番茄及其他重要作物   　 的抗逆境性狀之生物技術。這些植物將進行生物晶   　 片分析，同時也利用LC-MS-MS進行蛋白質差異比對   　 ，再以代謝體分析圖譜來瞭解一次及二次代謝物在   　 逆境下的差異圖譜，以瞭解抗逆境調控機制。我們   　 期望可以生產出能夠抵抗環境之水稻新品系，並協   　 助台灣農業尖端生技產業之發展。   (3)決定植株高度與分蘗數相關的水稻基因: 鑑定植物   　 構型相關的新基因，並針對其作後續的功能性分析   　 。先前，我們已發現數個與決定植株高度與分蘗數   　 相關的水稻基因。我們將訂定這些基因的訊號傳遞   　 路徑，及與之互動的蛋白質，以瞭解整個分子網路   　 架構。   (4)篩選增進誘發蝴蝶蘭擬原球體發育的轉譯分子：使   　 用RNA定序技術來分析和比較發育中的胚、原球體和   　 擬原球體的基因群。找出原球體/擬原球體和發育中   　 的胚組織不同調控的轉錄因子。並於篩選後分離和   　 鑑定具有維持和/或誘導擬原球體分生組織的能力的   　 轉錄因子。並經由瞭解轉錄調控因子的功能研究誘   　 發蝴蝶蘭擬原球體的發生加速組織培養效率，增進   　 蘭花生技的研發能量。